A lo largo de su vida, Mario Cobo Barona recibió varias condecoraciones y distinciones. Una de ellas es la que recibió de parte del Ministerio de Educación Pública, por sus valiosos aportes educativos.

El Municipio del cantón Pelileo, en Tungurahua, también lo honró con una mención especial por sus aportes en materia de historia local.

El Municipio de Ambato le entregó una condecoración al mérito cívico, educativo y cultural, con la distinción Juan León Mera.

El 31 de julio de 1997 se incorpora como miembro a la Academia Ecuatoriana de la Lengua (AEL), con la ponencia titulada Una Historia entre Romances.

El 17 de enero de 2002 ingresa a la AEL en calidad de Académico de Número, en Ambato. Su discurso versó sobre el tema ‘Bernardino Echeverría, académico, pastor y poeta ecuatoriano’.